Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4931428L18RikQ9D4S9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms