Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clvs1Q9D4C9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms