Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhc2Q9D485 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhc2Q9D485 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms