Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933428M09RikQ9D3X3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms