Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vsig1Q9D2J4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms