Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9330161L09RikQ9D253 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9330161L09RikQ9D253 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
9330161L09RikQ9D253 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms