Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Susd3Q9D176 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms