Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc167Q9D162 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc167Q9D162 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms