Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem53Q9D0Z3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem53Q9D0Z3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms