Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T7

Gkn3, Gastrokine-3, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn3Q9D0T7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gkn3Q9D0T7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms