Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lsm12Q9D0R8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lsm12Q9D0R8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms