Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pbdc1Q9D0B6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pbdc1Q9D0B6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms