Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc47Q9D024 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms