Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nde1Q9CZA6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms