Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snf8Q9CZ28 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snf8Q9CZ28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms