Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prelid3bQ9CYY7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms