Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hdhd3Q9CYW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms