Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SdhdQ9CXV1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SdhdQ9CXV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SdhdQ9CXV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SdhdQ9CXV1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SdhdQ9CXV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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