Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Exo5Q9CXP9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Exo5Q9CXP9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Exo5Q9CXP9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Exo5Q9CXP9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Exo5Q9CXP9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Exo5Q9CXP9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Exo5Q9CXP9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Exo5Q9CXP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms