Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed5Q9CXE7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms