Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc3Q9CXE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc3Q9CXE6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Xrcc3Q9CXE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Xrcc3Q9CXE6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc3Q9CXE6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Xrcc3Q9CXE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Xrcc3Q9CXE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Xrcc3Q9CXE6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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