Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mgme1Q9CXC3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms