Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Utp23Q9CX11 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Utp23Q9CX11 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms