Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sft2d3Q9CSV6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sft2d3Q9CSV6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms