Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ska2Q9CR46 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms