Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl28Q9CR40 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl28Q9CR40 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms