Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4931417E11RikQ9CR05 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms