Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg12Q9CQY1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms