Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifitm3Q9CQW9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm3Q9CQW9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms