Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rer1Q9CQU3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rer1Q9CQU3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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