Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Smim8Q9CQQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim8Q9CQQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms