Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc2Q9CQP2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc2Q9CQP2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms