Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DenrQ9CQJ6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DenrQ9CQJ6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms