Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ergic3Q9CQE7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ergic3Q9CQE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms