Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap3bQ9CQE1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms