Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rpl39lQ9CQD0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Rpl39lQ9CQD0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl39lQ9CQD0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl39lQ9CQD0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl39lQ9CQD0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rpl39lQ9CQD0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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