Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CQC3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms