Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nudcd2Q9CQ48 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms