Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Commd4Q9CQ02 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms