Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ska1Q9CPV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ska1Q9CPV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms