Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Bhlhe41Q99PV5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Bhlhe41Q99PV5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms