Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt23Q99PS0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt23Q99PS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms