Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL8

Slc19a3, Thiamine transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a3Q99PL8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc19a3Q99PL8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms