Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Bco2Q99NF1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Bco2Q99NF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bco2Q99NF1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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