Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms