Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ms4a4dQ99N05 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ms4a4dQ99N05 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ms4a4dQ99N05 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4dQ99N05 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ms4a4dQ99N05 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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