Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrrtQ99MR6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrrtQ99MR6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrrtQ99MR6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms