Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KarsQ99MN1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KarsQ99MN1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms