Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nkd1Q99MH6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nkd1Q99MH6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nkd1Q99MH6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkd1Q99MH6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms