Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rcbtb2Q99LJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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